MotoGP第16戦日本GP、Moto2クラスは、栃木県のツインリンクもてぎで予選を行い、フランセスコ・バニャイア（カレックス）が1分50秒759でポールポジションを獲得した。
セッション序盤をリードしたのはファビオ・クアルタラロ（スピードアップ）。クアルタラロは開始6分すぎに1分51秒254をマークしてリーダーボートのトップに立つ。
しかし、バニャイアが直後に1分50秒889を記録してこれを逆転。さらに開始12分すぎには1分50秒759とファステストを更新し、今シーズン6回目となるポールポジションを獲得した。
クアルタラロは残り2分で自己ベストを更新する1分50秒924をマークして2番手を獲得、今シーズン3回目となるフロントロウを獲得した。
クアルタラロに逆転されるまで2番手につけていたイケル・レクオーナ（KTM）が1分50秒990で3番手に続き、グランプリ初のフロントロウを獲得。
4番手に1分51秒043でマーセル・シュロッター（カレックス）、5番手に1分51秒092でロレンソ・バルダッサーリ（カレックス）、6番手に1分51秒250でアレックス・マルケス（カレックス）、7番手に1分51秒313でチャビ・ビエルゲ（カレックス）の順で続く。
Moto2クラスで唯一の日本人ライダー、長島哲太（カレックス）は開始10分すぎに1分51秒327を記録して4番手に浮上したが、その後、自己ベストを更新できなかったものの、8番手とホームレースでグランプリベストグリッドを獲得した。
ランキング2位でバニャイアを追うミゲール・オリベイラ（KTM）が1分51秒331で9番手、オリベイラのチームメイト、ブラッド・ビンダー（KTM）が1分51秒340で10番手に続いた。
以下、Moto2予選順位結果。
■MotoGP第16戦日本GP Moto2予選順位結果
天候：晴れ 路面：ドライ
Pos. No. Rider Team Motorcycle Time
1 42 F.バニャイア SKY Racing Team VR46 カレックス 1’50.759
2 20 F.クラルタラロ MB Conveyors – Speed Up スピード・アップ 1’50.924
3 27 I.レクオーナ Swiss Innovative Investors KTM 1’50.990
4 23 M.シュロッター Dynavolt Intact GP カレックス 1’51.043
5 7 L.バルダッサーリ Pons HP40 カレックス 1’51.092
6 73 A.マルケス Estrella Galicia 0,0 Marc VDS カレックス 1’51.250
7 97 X.ビエルゲ Dynavolt Intact GP カレックス 1’51.313
8 45 長島 哲太 IDEMITSU Honda Team Asia カレックス 1’51.327
9 44 M.オリベイラ Red Bull KTM Ajo KTM 1’51.331
10 41 B.ビンダー Red Bull KTM Ajo KTM 1’51.340
11 10 L.マリーニ SKY Racing Team VR46 カレックス 1’51.343
12 40 A.フェルナンデス Pons HP40 カレックス 1’51.359
13 87 R.ガードナー Tech 3 Racing テック3 1’51.505
14 36 J.ミル Estrella Galicia 0,0 Marc VDS カレックス 1’51.555
15 9 J.ナバーロ Federal Oil Gresini Moto2 カレックス 1’51.638
16 24 S.コルシ Tasca Racing Scuderia Moto2 カレックス 1’51.666
17 77 D.エガーター Kiefer Racing KTM 1’51.769
18 16 J.ロバーツ NTS RW Racing GP NTS 1’51.797
19 22 S.ロウズ Swiss Innovative Investors KTM 1’51.808
20 5 A.ロカテッリ Italtrans Racing Team カレックス 1’51.822
21 54 M.パッシーニ Italtrans Racing Team カレックス 1’51.862
22 57 E.ポンス MB Conveyors – Speed Up スピード・アップ 1’51.899
23 89 K.パウィ IDEMITSU Honda Team Asia カレックス 1’52.258
24 2 J.ラフィン SAG Team カレックス 1’52.378
25 4 S.オーデンダール NTS RW Racing GP NTS 1’52.505
26 64 B.ベンスナイダー Tech 3 Racing テック3 1’52.549
27 62 S.マンジ Forward Racing Team スーター 1’52.625
28 66 N.トゥーリ Petronas Sprinta Racing カレックス 1’52.775
29 32 I.ビニャーレス Forward Racing Team スーター 1’53.222
30 95 J.ダニーロ Nashi Argan SAG Team カレックス 1’53.755
31 18 X.カルデルス Marinelli Snipers Team カレックス 1’53.870
32 21 F.フリーニ Tasca Racing Scuderia Moto2 カレックス 1’54.199
