クラブ存続の危機を乗り越えて、リーグ2位で初のJ1昇格を決めた。勝利数24、勝ち点80、総得点数59は、いずれもクラブ記録を大幅に塗り替えた。
2月に経営難が明らかになり、不安を抱えながら開幕を迎えたが、4月にジャパネットホールディングス（佐世保市）の子会社として再出発した。以降、徐々に調子を上げて、第30節から最終節までは13戦無敗。一気に自動昇格圏まで駆け上がった。
11ゴールでチーム得点王のFWファンマ（現アビスパ福岡）は、体の強さと技術を生かしたポストプレーでも活躍。MF翁長聖（現大宮アルディージャ）は豊富な運動量で左サイドから好機を演出した。リーグ戦の終盤は日替わりヒーローが誕生。終了間際に勝ち越し弾や同点弾が生まれる劇的な試合が続いた。
勝てば昇格が決まるという中でキックオフした11月11日の第41節カマタマーレ讃岐戦は、ホーム過去最多の2万2407人が来場。チーム最古参のMF前田悠佑（現V長崎普及インストラクター）が後半28分に「一生忘れられないゴール」という決勝点を挙げると、スタジアムは熱狂の渦に包まれた。
